Gökhan Zan, 7 Eylül 1981 tarihinde Hatay'ın Antakya ilçesinde dünyaya geldi. Futbola 1997 senesinde Hatayspor altyapısında başlayan Zan, ilk profesyonel sözleşmesini de 1999 senesinde Hatayspor ile imzaladı. Profesyonel futbol kariyeri başladıktan sonra Hatayspor'da yalnızca 1 sezon geçiren Zan, 2000 senesinde Çanakkale Dardanelspor'a transfer oldu.
2000-03 yılları arasında Çanakkale Dardanelspor bünyesinde 80 maçta görev alan Gökhan Zan, mevkii gereği fazla gol şansı bulamasa da 9 gol ile takımına katkı sağladı. 2003 senesinde Süper Lig'in köklü kulüplerinden Beşiktaş'a transfer oldu. 2004-05 sezonunda Gaziantepspor'a kiralandı.
Sonraki sezon Beşiktaş kadrosuna geri çağrılan Zan, 2003-09 yılları arasında 69 maçta forma şansı buldu ve 4 kez rakip ağları havalandırdı. Burada takımıyla birlikte 2009 senesinde Süper Lig şampiyonluğu, 2006 senesinde Türkiye Süper Kupası birinciliği ve 2006, 2007, 2009 yıllarında olmak üzere 3 Türkiye Kupası birinciliği elde etti.
2009 senesinde Galatasaray'a transfer oldu. 2015 senesinde futbolu bırakana dek Galatasaray formasıyla 56 maçta şans bulan Zan, 3 gol ile takımına katkı sağladı. Galatasaray ile 2012, 2013 yıllarında Süper Lig şampiyonluğu, aynı senelerde Türkiye Süper Kupası birinciliği ve 2014 senesinde Türkiye Kupası birinciliği elde etti. Ayrıca Gökhan Zan, 2006-2013 yılları arasında Türkiye A Milli Futbol Takımı forması giydi.
